Principes des Techniques de Biologie Moléculaire et Génomique : 3e édition Revue et Augmentée.

Intro -- Sommaire -- Avant-propos -- Remerciements -- Liste des rédacteurs -- Partie 1 - Les bases -- Fiche 1 - Structure et expression d'un gène eucaryote codant un ARNm et une protéine -- Fiche 2 - Définition des ARN non codants -- Fiche 3 - Paramètres de description d'un génome -- Fiche 4 - Enzymes de restriction -- Fiche 5 - Électrophorèse des acides nucléiques -- Fiche 6 - PCR (Polymerase Chain Reaction) -- Fiche 7 - Description d'un plasmide et d'un phagemide -- Fiche 8 - Description d'un YAC et autres grands vecteurs -- Fiche 9 - Clonage moléculaire -- Fiche 10 - Transformation génétique des bactéries et des levures -- Fiche 11 - Construction de banques d'acides nucléiques -- Fiche 12 - Extraction d'ADN -- Fiche 13 - Extraction d'ARN -- Fiche 14 - Marquage des acides nucléiques (ADN et ARN) -- Fiche 15 - Hybridation moléculaire -- Fiche 16 - Hybridation in situ d'ARN -- Fiche 17 - La cytogénétique moléculaire : FISH, GISH -- Fiche 18 - Électrophorèse en champ pulsé -- Partie 2 - Caractérisation d'un gène -- Fiche 19 - Séquençage d'ADN par la technique Sanger -- Fiche 20 - RT-PCR (Reverse Transcription - Polymerase Chain Reaction) -- Fiche 21 - PCR quantitative -- Fiche 22 - Amplification rapide d'extrémités d'ADNc : RACE -- Fiche 23 - Transcription in vitro -- Fiche 24 - Détermination du site d'initiation de la transcription -- Fiche 25 - Gel-retard -- Fiche 26 - Production de protéines recombinantes -- Fiche 27 - Système du double hybride -- Partie 3 - Analyse de la fonction d'un gène par mutagenèse ou transgenèse -- Fiche 28 - Grands principes de la transgenèse et de la mutagenèse -- Fiche 29 - Transfert de gènes -- Fiche 30 - Transgenèse chez la souris -- Fiche 31 - Analyse de la fonction d'un gène par mutagenèse ou transgenèse chez les poissons -- Fiche 32 - Transgenèse chez Drosophila melanogaster.

Fiche 33 - Transgenèse de Caenorhabditis elegans -- Fiche 34 - Transgenèse stable des plantes par les agrobactéries -- Fiche 35 - Techniques de ARNi (ARN interférence) -- Fiche 36 - Transformation des plantes par agro-infiltration par Agrobacterium tumefaciens -- Fiche 37 - Analyse fonctionnelle de promoteurs -- Fiche 38 - Mutagenèse chimique du génome de drosophile -- Fiche 39 - Mutagenèse d'insertion -- Fiche 40 - Le TILLING (Targeting-Induced Local Lesions IN Genomes) -- Fiche 41 - Mutagenèse dirigée par le système CRISPR-Cas9 -- Partie 4 - Approches haut débit -- Fiche 42 - Séquencer un génome : généralités -- Fiche 43 - Séquençage d'ADN par la technique Illumina -- Fiche 44 - Séquençage d'ADN par la technique Single Molecule Real Time (SMRT) : PacBio -- Fiche 45 - Séquençage d'ADN grande longueur par la technique Nanopore -- Fiche 46 - Séquençage d'ADN par la technique Ion Torrent™ -- Fiche 47 - Séquençage d'ADN grande longueur « synthétique » par la technique 10X Genomics® -- Fiche 48 - Cartographie optique de génomes (Optical Mapping) -- Fiche 49 - La capture d'exons -- Fiche 50 - Métagénomique et métatranscriptomique -- Fiche 51 - Barcoding et métabarcoding -- Fiche 52 - Analyse des données RNA-seq (RNA-sequencing) -- Fiche 53 - Interactions protéines-ARN à la résolution du nucléotide (iCLIP) -- Fiche 54 - Méthodes d'analyse du traductome -- Fiche 55 - Structure de la chromatine : introduction -- Fiche 56 - Immunoprécipitation de la chromatine (ChIP) -- Fiche 57 - Analyse tridimensionnelle de la chromatine par Chromosome Conformation Capture : les techniques 3C, 4C-seq et Hi-C -- Fiche 58 - Techniques d'identification de régions génomiques accessibles à des régulateurs : FAIRE et ATAC -- Fiche 59 - Méthode de détermination du positionnement des nucléosomes : MAINE -- Fiche 60 - La méthylation de l'ADN.

Partie 5 - Étude du polymorphisme d'un génome -- Fiche 61 - Les principaux types de polymorphisme -- Fiche 62 - Microsatellites, répétitions de séquences simples : SSR -- Fiche 63 - Génotypage SNP (Single Nucleotide Polymorphism) -- Fiche 64 - Utilisation des polymorphismes : QTL, GWAS et scans génomiques -- Fiche 65 - Détermination du polymorphisme par séquençage de nouvelle génération -- Fiche 66 - Approches populationnelles par séquençage en pools (Pool-Seq) -- Fiche 67 - Détection génomique de CNV par nouvelles technologies de séquençage -- Fiche 68 - Étude du polymorphisme par séquençage d'ADN associé à des sites de restriction (RAD-seq) -- Fiche 69 - Génotypage par séquençage : GBS (Genotyping By Sequencing) -- Partie 6 - Bioanalyses -- Fiche 70 - Assemblage de génomes -- Fiche 71 - Annotation de génomes -- Fiche 72 - Galaxy -- Fiche 73 - La programmation.

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